微生物群落鉴定

微生物群落鉴定

本文关键词:菌种鉴定、微生物检测、微生物鉴定、混合微生物鉴定、滤网微生物、水系统微生物


在药品和食品行业生产中经常会遇到无法分离培养的、未知的多种微生物混合在一起的情况,这对于生产质量管控方面是个棘手问题。利用传统表型鉴定技术难以对这类样本进行微生物鉴定。

基因测序技术的发展,使得这个问题得到解决。通过对复杂样本(微生物群落样本)直接进行DNA提取,然后在保守区设计引物,利用PCR反应扩增出高变区序列,由于可能是多种微生物序列,一代测序无法进行多序列测序,需要通过高通量测序技术进行深度测序,得到所有微生物的高变区序列信息,再通过生物信息学分析技术对得到的序列信息进行序列统计和数据库比对分析,最后得到该复杂样本中的微生物种属组成和比例。

优势:

1、无需分离培养,直接在复杂样本中提取微生物DNA测序,可鉴定到传统方法无法分离培养的微生物。

2、仅需微量样本就可以进行测序鉴定。

3、一次可对多种微生物进行测序。

应用场景:

1、洁净区通风口滤网微生物检测;

2、超纯水系统滤芯微生物检测;

3、原料、中间产品及终产品整体微生物检测;

4、新建洁净厂房、C/D级区环境微生物的快速评估;

5、肠道微生态检测。